Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDKN3Q16667 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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