Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPL26P34-201ENST00000431005 451 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC107029.1-201ENST00000484675 465 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC114801.1-201ENST00000512633 297 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SAXO2-204ENST00000565432 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SPIN2B-201ENST00000275988 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TMED5-201ENST00000370280 750 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SKP168-201ENST00000410910 300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms