Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
SYCP1Q15431 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SYCP1Q15431 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms