Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
BRD3Q15059 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BRD3Q15059 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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