Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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COL4A6Q14031 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
COL4A6Q14031 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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