Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
ATP1A4Q13733 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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