Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GPS1Q13098 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GPS1Q13098 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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