Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
NPRL3Q12980 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms