Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms