Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
FOXF2Q12947 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms