Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CTLA4P16410 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CTLA4P16410 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CTLA4P16410 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CTLA4P16410 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CTLA4P16410 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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CTLA4P16410 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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CTLA4P16410 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTLA4P16410 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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