Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LINC01231-201ENST00000452746 886 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 IGKV1-6-201ENST00000464162 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC004801.2-201ENST00000468202 779 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 IGKV1-9-201ENST00000493819 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00498-201ENST00000504369 455 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TMEM92-202ENST00000507382 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 EVX1-AS-201ENST00000517726 480 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC091982.1-201ENST00000518134 520 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 IGKV2D-18-201ENST00000519785 375 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SDC2-207ENST00000522911 677 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC011379.2-201ENST00000523154 583 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AAMDC-204ENST00000525409 421 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PRR13P2-201ENST00000533804 406 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 COA4-202ENST00000537289 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AP006545.1-201ENST00000563059 911 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DCTN5-204ENST00000563998 878 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LRRC75A-AS1-223ENST00000581361 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC015802.4-203ENST00000592622 570 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 GMDS-AS1-215ENST00000606884 580 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR6892-201ENST00000612346 115 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MIR6083-201ENST00000612737 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC024559.2-202ENST00000615240 529 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CR381653.1-205ENST00000623409 580 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-213ENST00000632086 918 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 INTS4-211ENST00000535943 1382 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC108704.2-201ENST00000623017 1565 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 USP17L17-202ENST00000614762 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 USP17L13-202ENST00000616303 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 USP17L22-202ENST00000622009 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DAZ4-203ENST00000382432 2405 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 DAZ2-205ENST00000382433 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 WFDC10B-201ENST00000330523 630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 PRRG3-202ENST00000370354 650 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FHAD1-203ENST00000375995 785 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 FRG1JP-201ENST00000376334 931 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ANKRD39Q53RE8 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms