Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM71Q2Q1W2 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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