Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms