Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 VN1R33P-201ENST00000411800 887 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ZNF32-AS1-201ENST00000453284 434 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 GAPDHP38-201ENST00000503632 1002 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ARNTL2-203ENST00000311001 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
FXNQ16595 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FXNQ16595 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
FXNQ16595 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms