Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
USF2Q15853 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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