Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OMA1-201ENST00000371226 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SVBP-201ENST00000372521 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC02010-201ENST00000470860 516 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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VAMP3Q15836 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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VAMP3Q15836 AL161747.2-201ENST00000535893 472 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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VAMP3Q15836 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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VAMP3Q15836 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
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VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
VAMP3Q15836 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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