Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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SIX1Q15475 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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