Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ALCAMQ13740 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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