Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FHL3Q13643 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms