Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TOP3AQ13472 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DCTN5-204ENST00000563998 878 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TOP3AQ13472 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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