Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
DUSP4Q13115 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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