Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
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