Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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