Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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HOXA13P31271 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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HOXA13P31271 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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HOXA13P31271 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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HOXA13P31271 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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HOXA13P31271 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
HOXA13P31271 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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HOXA13P31271 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXA13P31271 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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