Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NEDD8-MDP1E9PL57 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms