Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC022898.1-202ENST00000560864 806 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SALL4Q9UJQ4 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RN7SKP85-201ENST00000411349 318 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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SALL4Q9UJQ4 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SALL4Q9UJQ4 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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