Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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