Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R2B-202ENST00000394409 10704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
LRRIQ1Q96JM4 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
LRRIQ1Q96JM4 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms