Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
C17orf47Q8NEP4 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms