Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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CCDC96Q2M329 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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CCDC96Q2M329 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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CCDC96Q2M329 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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CCDC96Q2M329 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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CCDC96Q2M329 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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CCDC96Q2M329 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC96Q2M329 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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