Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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