Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CDKN3Q16667 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms