Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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ECM1Q16610 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
ECM1Q16610 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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