Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GCSHP1-201ENST00000512554 484 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RNA5SP287-201ENST00000516358 103 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 RGS5-220ENST00000528689 566 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CCDC85BQ15834 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms