Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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SIX1Q15475 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SIX1Q15475 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SIX1Q15475 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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