Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms