Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms