Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
TSPAN31Q12999 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TSPAN31Q12999 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms