Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXF2Q12947 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXF2Q12947 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXF2Q12947 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXF2Q12947 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF2Q12947 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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