Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PTPRCP08575 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms