Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ERVV-1B6SEH8 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms