Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXP3Q9BZS1 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms