Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.9 ms