Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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LRRC38Q5VT99 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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LRRC38Q5VT99 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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LRRC38Q5VT99 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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LRRC38Q5VT99 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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LRRC38Q5VT99 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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LRRC38Q5VT99 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC38Q5VT99 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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