Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TAF1AQ15573 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms