Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 HERC2P2-205ENST00000619021 5746 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 KLHL3-201ENST00000309755 6806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 IGSF1-206ENST00000370910 4406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SORBS2-209ENST00000418609 5529 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ARHGAP32-206ENST00000527272 5289 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 FAXC-201ENST00000389677 11508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 KIZ-AS1-203ENST00000616177 5370 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ADGRG6-201ENST00000230173 7026 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MAP7D3-204ENST00000370663 4446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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