Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms