Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
TCIRG1Q13488 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCIRG1Q13488 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241 ms