Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL352979.1-201ENST00000554238 297 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL139300.2-201ENST00000556332 553 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC008737.3-201ENST00000601661 221 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL157392.3-206ENST00000614899 822 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC074029.3-201ENST00000618623 312 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 DEFB104A-201ENST00000314265 281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 DEFB104B-201ENST00000316169 281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 LCN1P1-201ENST00000372031 505 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 MIR25-201ENST00000384816 84 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC004009.1-201ENST00000412413 567 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 CYCSP5-201ENST00000415043 297 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 AC114760.1-201ENST00000420310 652 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
UBE2V1Q13404 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms